医疗垃圾处理设备系统总流程：
1.前期高温杀毒灭菌和破碎;
2.后期生物质分解获取经济价值
医疗垃圾前期处理具体操作过程：
周转箱进料→灭菌处理→出料→破碎处理→传输收集→周转箱自动清洗→再度循环使用
医疗垃圾后期处理设备(生物质分解)流程
将经过高温蒸煮后的医疗垃圾直接输送到低温常压生物质分解处理器中，催化加热，馏出油蒸汽，油气通过冷凝器，可液化部分，冷凝为混合油，不可液化部分通过气体净化系统处理后经燃气系统捅入处理器底烧掉，既节约燃料能源又不污染环境。
燃烧后产生的烟气进入喷淋塔，与水泵抽送的碱液混合(水池中掺有碱液)，此时碱液中的碱性物质与烟气气体中的酸性物质发生酸碱中和反应，达到清除烟气气体中酸性物质的目的。
烟气气体经酸碱中和后，通过吸附塔中的填料除去烟气气体中的残余碱液，流回水池内，清洁的烟气外排，完成烟气的脱硫除尘净化处理;裂解后的残渣经过密封绞笼输送到炭黑集渣罐，环保无污染。
任何有机垃圾物高分子，无论是“荤”的、“素”的还是“人造”的，都是由基本有机分子合成而来，只是它们各自的合成条件和环境不尽相同。按照有机物质的基本合成反应规律都应该存在合成反应的逆条件，如果能有效地找到该类逆条件，则有机物大分子都应该能被裂解。因此，如何找到逆条件和建立逆向工程体系是实现能将有机垃圾物质送“回家”（热解还原）的关键。经过多年研发，发现了生成这种逆条件的逆向工程体系。这种逆向工程体系实现了资源类物质再循环：将垃圾物质的资源性价值保留下来，重新回到构成垃圾物质前的物性状态，然后再将这些资源类物质重新再造和利用。这应是人类打通和实现物质循环利用的较高境界了。