原子荧光光度计按数字[3]键进入③Concentration (浓度测定模式或标准曲线模式)，选中对应的数字来设定条件(波长数目，波长数值，标准溶液数目及浓度)，设定完毕后点击[Enter]键确定，所有项目设定完毕后按数字[0]键确定，等待仪器调整至准备状态，此时屏幕上出现AUTOZERO，将盛有空白溶液的比色皿放入样品室中，按[Start/Stop] 键进行零点的自动调整，自动调零完成后，将标准溶液置于光路中，按照浓度从低到高顺序依次按[Start/Stop] 键进行测量，测量完毕后仪器将自动给出标准曲线，标准曲线下方有三项供选择：①Process(更改标准曲线的坐标和观察浓度回归曲线的数据);②Measure(直接进入样品的测量);③Print(打印浓度回归曲线谱图和数据)，选中对应的数字就可执行相应的功能。
原子荧光光度计光度计的设计原理和工作原理，允许吸光值在一定范围内变化，即仪器有一定的准确度和精确度。如Eppendorf Biophotometer的准确度≤1.0%（1A）。这样多次测试的结果在均值1.0%左右之间变动，都是正常的。另外，还需考虑核酸本身物化性质和溶解核酸的缓冲液的pH值，离子浓度等：在测试时，离子浓度太高，也会导致读数漂移如TE，可大大稳定读数。样品的稀释浓度同样是不可忽视的因素：由于样品中不可避免存在一些细小的颗粒，尤其是核酸样品。这些小颗粒的存在干扰测试效果。为了大程度减少颗粒对测试结果的影响，要求核酸吸光值至少大于0.1A，吸光值好在0.1-1.5A。在此范围内混合液不能存在气泡，空白液无悬浮物，否则读数漂移剧烈；必须使用相同的比色杯测试空白液和样品，否则浓度差异太大；换算系数和样品浓度单位选择一致；不能采用窗口磨损的比色杯；样品的体积必须达到比色杯要求的小体积等多个操作事项。