因医疗垃圾本身具有特殊属性，也就需要特殊的处理方式来消除其危害性和危险性。对于这些高传染性、高毒害性的医疗废物，应该由专门的医疗垃圾处置中心来处理才对，但现实中却存在诸多问题，如随意丢弃或混入生活垃圾或将医疗废物卖给小贩。
根据《医院感染管理办法》规定,医疗卫生机构应当根据就近集中处置的原则，及时将医疗废物交由医疗废物集中处置单位处置，医疗废物集中处置单位根据《医疗废物集中处置技术规范（试行）》、《医疗废物高温蒸汽集中处理工程技术规范（试行）》等标准进行集中处置。但是目前仍存在不具备集中处置医疗废物条件的农村医疗机构,采用直接焚烧或直接填埋等方式处置医疗废物，直接焚烧医废后会产生大量的二恶英等有害物质,随之带来二次污染。同时,一些具有损伤性医废,如镊子、针灸针、针头是不可燃的，只能通过掩埋来处理这些医废,但是这样又会污染地下水源。
医疗垃圾高温热解炉被称为第三代固废处理技术的垃圾热解气化工艺，是一种包含医疗垃圾在内的全新固废处理方法。其工作原理是指在厌氧及一定热力条件下将医疗垃圾等固废物中的有机物通过分子链结构的改变，转化为主要由一氧化碳，氢气和低分子烃类组成的可燃气的过程。该技术整个工艺流程所产生的气体、固体物和水都能经过处理回收，其除了具备传统高温焚烧的优点外也实现了占地面积小设备建设运营成本低等特点，同时解决了高压蒸汽灭菌法的一些弊端特别是整个处理过程全封闭，实现了无烟尘污染、无异味扩散、无二噁英产生，基本实现零污染。
在医疗垃圾的实际处理中，要以杀菌和无害化，无二次污染的前提下，充分考虑不同服务区域的处置规模、区域的经济发展水平、环境意识及地方规划等条件，优先推广和应用热解气化处理技术。医疗垃圾高温热解炉